Základní škola Rudolfov se nachází v pomyslném středu Rudolfova, v těsné blízkosti točny MHD a kostela sv. Víta. Budova školy i kostel jsou viditelné z frekventované hlavní silnice vedoucí z Českých Budějovic směrem na Třeboň.
Školní areál tvoří dvě staré budovy s novější panelovou přístavbou. Obě budovy jsou vzájemně propojeny spojovací chodbou.
V budovách školy je celkem 15 kmenových učeben, dvě učebny, které v současné době využívá pro svou činnost pouze školní družina, dále pak odborná učebna informatiky, učebna jazyků, školní kuchyňka a pro výuku technických činností je k dispozici školní dílna. Jedna z místností slouží pro potřeby školní knihovny. K výuce pěstitelských prací je využit školní pozemek.
V současné době probíhá rekonstrukce budovy druhého stupně, která bude dokončena v listopadu 2011. Podkrovní přístavbou vzniknou dvě nové kmenové učebny, moderní počítačová učebna, nová ředitelna, kancelář, kabinet pro pedagogické pracovníky a sociální zabezpečení.
Tělesná výchova je vyučována v tělocvičně sportovní haly, v omezené míře na fotbalovém hřišti SK Rudolfov a veřejném hřišti na Farské louce. V tělocvičně probíhají každý den v odpoledních hodinách zájmové sportovní aktivity žáků školy. Letitým problémem je zcela chybějící atletická dráha a sektor pro skok daleký. Škola tudíž podporuje snahu SK Rudolfov o vybudování komplexního sportovního areálu s veškerým zázemím.